При негерметичной системе и наличии воздуха в ней та же картина у меня возникала. При недостаточной циркуляции через печку по причине ее забития или некорректного подключения гбо - аналогично. Просто гонять воздух в салоне и подогревать только что нагретый воздух оно еще как-то может, а вот производительности печки чтобы прогреть воздух с улицы уже не хватает.